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304永利:作科304永利构建谷子模式品种定向突变筛选数据库

3月3日,304永利特色农作物优异种质资源发掘与创新利用团队,构建了谷子模式品种Ci846的基因组饱和突变体库及定向突变筛选网络数据库,为谷子功能基因组研究和分子设计育种提供了高效研究工具。相关研究成果在线发表在《植物生物技术(Plant Biotechnology Journal)》上。

谷子是起源于我国的禾谷类特色杂粮作物,因其具有基因组小、基因组的重复序列少、二倍体单穗结实多、便于繁殖、C4高光效等特点,近年来正在发展为解析作物形态建成、性状形成机理的模式作物,而谷子地方品种资源Ci846是理想的基因功能研究模式材料,具有生长周期短、便于室内高效扩繁的优势,被众多科学家认定为谷子基础研究的模式品种。因此,利用模式品种实现谷子目标基因突变材料的快速获。墙徊酵晟乒茸幽J窖芯科教ǖ墓丶。

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研究团队利用化学诱变结合高通量基因型鉴定技术,构建了一个包含9243个诱变2代植株的Ci846大型EMS诱变突变体库,在此基础上对4109株诱变2代植株基因组测序形成目前已报道最大规模的突变体基因型数据集合,并将相关数据整合构建了网络查询数据库(www.setariadb.com/millet/mutation)。据统计,该数据库变异位点达到了2,899,449个,基因组平均突变密度为1/29.70 Kb,覆盖了已报道的304永利有谷子功能基因。进一步利用该突变体库和基因型数据库,实现了谷子极早熟基因 SiPHYB 和黄绿叶基因 SiYGL1 的快速挖掘,证实该平台开展目标基因快速定向筛选和基因组学研究的可行性和高效性。

作科304永利博士研究生张慧、梁红凯为论文的共同第一作者,贾冠清研究员、刁现民研究员和贺强研究员为论文的共同通讯作者。该研究得到国家重点研发计划、农业生物育种专项、国家自然科学基金、作物基因资源与育种全国重点实验室、国家谷子高粱产业技术体系、304永利青创专项等项目的资助。

文章链接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/pbi.14594



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